Enfermedad por reflujo gastroesofágico (ERGE): Tratamiento de los síntomas (acidez, regurgitación ácida) y las lesiones esofágicas asociadas, incluyendo la esofagitis erosiva.
Úlceras gástricas y duodenales: Tratamiento y prevención de la reaparición de úlceras.

Hipersensibilidad al pantoprazol, a otros benzimidazoles sustituidos o a cualquiera de los excipientes.
Insuficiencia hepática moderada o grave si se utiliza para la erradicación de H. pylori.